在距离省治较偏远的地区，分道设宣慰司，处理当地军民事务。负责民政的官员属中书省管辖，负责军务的官员属枢密院管辖。边陲民族地区的宣抚、安抚、招讨等司，多参用当地土官任职。

行省之职守，凡钱粮、兵甲、屯种、漕运、军国重事，无不领之。每省置丞相一员(例不常设)、平章二员，品秩比中书省低一等；右丞、左丞、参知政事等，品秩与都省官相同。各省的政务需要通过中书省进行协调统一或向皇帝报告。行省与都省之间具有某种程度的从属关系。

中书省和行省以下的行政区划，依次为路、府、州、县。路设总管府，有达鲁花赤、总管，是为长官；有同知、治中、判官、推官，是为正官；还有总领六曹、职掌案牍的首领官(经历、知事、照磨)。府设有达鲁花赤、知府或府尹，同知、判官、推官，知事等官职。有的府隶属于诸路，有的直隶于行省；有的统领州县，有的则不统州县。州有达鲁花赤、州尹或知州，以及同知、判官等官。有些州直隶于路或行省，有的州不统县。县有达鲁花赤、县尹等官。有些县直隶于路或府。

边远地区还有军的建制，品秩及设官置吏皆如下州。路治所在的都市，设一个或几个录事司(大都、上都设警巡院)，管理市镇居民。司内置达鲁花赤、录事、录判等官员。

各级行政官员的任命权都掌握在中央，投下的州县，其达鲁花赤一职，由领有该地的诸王、贵戚或勋臣任命。

御史台在地方上也有相应的分设机构，即监临东南诸省的江南道行御史台(简称南台)和陕、甘、滇、蜀地区的陕西诸道行御史台(简称西台)。南台和西台品秩与中央御史台(内台)相同。内台、南台和西台以下各设若干道肃政廉访司。

为了征伐或镇抚的需要，枢密院有时也在有关地区设置行枢密院(简称行院)。

而朝廷的官衔等级则是由正一、从一品，一直到正九、从九品，大致如下。

正一品：

职官：太师、太傅、太保、中书令、中书省右左丞相。

文散官：开府仪同三司、仪同三司、特进、崇进、金紫/银青荣禄大夫。

爵：王。

勋官：上柱国。

从一品：

职官：中书省平章政事、行省丞相/平章政事、枢密院/大抚军院知院、御史大夫、宣政院/宣徽院/太禧宗禋院院使、大宗正府札鲁忽赤、大司农司大司农、翰林国史院承旨、集贤院大学士、詹事院詹事。

文散官：光禄大夫、荣禄大夫。

爵：郡王。

勋官：柱国。

正二品：

职官：中书省/行省右左丞、枢密/宣政院/宣徽院/詹事院同知、御史中丞、大都督府大都督、大司农/群牧监卿、太常礼仪院/典瑞院/太史院/太医院/将作院/中政院/储政院/资正院院使、翰林国史/集贤院学士、奎章阁学士院大学士、侍正府侍正、内史府内史、大都/上都留守司留守。

文散官：资德大夫、资政大夫、资善大夫。

武散官：龙虎卫上将军、金吾卫上将军、骠骑卫上将军。

内散官：中散大夫。

爵：国公。

勋官：上护军。

从二品：

职官：中书省/行省参知政事、枢密院/宣政院/宣徽院副使、通政院院使、侍御史、大司农少卿、太仆寺卿、翰林国史/集贤院侍读/侍讲学士、奎章阁学士院侍书学士、隆祥使司/崇福司司使、詹事院副詹事、宣慰司（都元帅府）宣慰使、大都督府大都督、都护府大都护、都总制庸田使司都总制庸田使。

文散官：正奉大夫、通奉大夫、中奉大夫。

武散官：奉国上将军、镇国上将军、镇国上将军。

内散官：中引大夫。

爵：郡公。

勋官：护军。

正三品：

职官：中书省/枢密院断事官、各部尚书、治书侍御史、奎章阁学士院承制学士、各寺卿、内史府中尉/断事官、都漕运使司运使、各卫/各亲军都指挥使司达鲁花赤/都指挥使、左右卫率府率使、都万户府都万户、上路/上万户府/上总管府达鲁花赤/万户/总管、左右都威卫使司使、元帅府达鲁花赤/元帅、宣抚司达鲁花赤/宣抚使、安抚司达鲁花赤/安抚使、招讨司达鲁花赤/招讨使、都转运盐使司都转运使、总管府达鲁花赤/总管、都水庸田使司庸田使。

文散官：正议大夫、通议大夫、嘉议大夫。

武散官：昭武大将军、昭勇大将军、昭毅大将军。

内散官：中御大夫。

爵：郡侯。

勋官：上轻车都尉。

从三品：

职官：太常礼仪院/典瑞院/太史院/太医院/中政院/储政院佥院、通政院副使、大司农丞、翰林国史/集贤院直学士、国子监祭酒、宣政院断事官、侍正府参府、武备寺同判、各监太监、都水监都水监、各卫/各亲军都指挥使司副指挥使、宣慰司/大都督府同知、左右卫率府副使、都万户府副都万户、大都督府副都督、上万户府副万户、中/下万户府达鲁花赤/万户、下路/下总管府达鲁花赤/总管、都总制庸田使司副使。